同時護廷十三番隊也是分別分工，各種有著自己的職責，守護屍魂界。
總隊，分派下達任務，管理指揮各個番隊，負責發布中央四十室的通知以及召開例行的隊長會議。
二番隊
隱密機動隊刑軍，負責處刑和暗殺以及秘密潛入調查任務的部隊。
三番隊
支援隊，當需要人手時負責支援除4番隊以外其它所有番隊的隊務，補充其他番隊在戰鬥中的人員傷亡。
四番隊
醫療隊，負責緊急救治以及日常醫療保健工作。
五番隊
救援隊，負責救援在現世殺虛遇到麻煩的死神和見習死神。出動必須經過1番隊許可。
六番隊
貴族專屬隊，代表維護貴族的利益。是負責保護死神界四大貴族利益的隊伍，歷代隊長必須由四大貴族之首的朽木家族當家擔任。
七番隊
內廷護衛隊，負責協助和保護一番隊及中央四十六室，特別是在其它番隊反叛的情況下。隊長必須經過1番隊許可。
八番隊
情報隊，負責收集情報，統計流魂街40區的動向以及其它番隊的動向。
九番隊
牢獄隊，負責審訊，逼問，和監禁一般囚犯。
十番隊
巡邏警備隊，負責靜靈廷內的治安，以及應付緊急情況，發布緊急資訊，由10番隊和1番隊聯合簽署的警報檔案為最高階警報。
十一番隊
戰鬥專用隊，負責第一線進攻的兇悍隊伍，代表屍魂界最精銳的專業戰鬥隊。
十二番隊
技術開發局，負責調測靈波，並監視現世的平均靈壓值，負責開發新的高科技産品。
十三番隊
淨化隊，淨化虛的主要力量，隊員多被派往現世執勤，長年與虛戰鬥。
不僅如此，屍魂界全境集中起來了四十位賢者和六名審判官，組成了屍魂界最高的司法機關中央四十六室，不過這些成員全都是由貴族與元老組成的，完全是為貴族服務，和平民沒有一毛錢關系。
而在這場戰爭結束了，王族特務隊吸收了一名新成員修多羅·千手丸。
並且徹底隱藏幕後，屍魂界所有事物都交給中央四十六室和十三番隊管理。同時王族特務隊也被人稱為零番隊，淩駕於十三番隊之上。