原本陳近南尊鄭成功為大哥，一直以輔佐鄭王府為己任，但鄭成功死後，繼承其延平郡王爵位的鄭經對陳近南卻一直心懷猜忌。
其子鄭克塽更是將這種猜忌流於表面，時常給陳近南與天地會兄弟難堪，讓陳近南心下痛苦萬分。
肖鵬與洪熙官等人都看不慣鄭王府的行徑，便故意尋釁，借機殺了鄭克塽的武學師父兼鄭王府重臣馮錫範。
洪熙官與肖鵬都是陳近南義結金蘭的兄弟，所謂忠義難兩全，況且鄭經父子如此對待他，陳近南也並不是像金大俠小說中那樣迂腐的人，故而陳近南與鄭王府徹底決裂。
從此天地會與鄭王府形同陌路，各行其事，肖鵬使了些手段，將天地會中的其他勢力臥底找出，清除掉後，天地會便正式開始與其他勢力爭奪天下。
有肖鵬這個絕世高手兼超級神箭手相助，其他勢力被一個一個的瓦解吞併，天地會勢力越來越大，實力暴漲。
青雲會見狀，知道天地會乃是天命所歸，當下在總舵主的率領下，主動投誠，自願併入天地會。
最終，陳近南依然不得不面對鄭王府，路已經走到這一步，局勢已經不是他能主動左右的了，很多時候，人都是被大勢逼著去走一些自己不願走的路。
陳近南輔佐鄭王府多年，對其兵力部署，戰法戰技等等情況瞭如指掌，加上此時天地會有三十萬大軍，猛將無數，更有肖鵬這個神級弓箭手。
在兩軍交戰中肖鵬專門對對方將領下手，很快就導致了鄭王府大軍無將領可用的尷尬局面。
後來鄭王府派出高手刺殺肖鵬，自然是來多少死多少，但鄭王府的這一行為終於惹怒了陳近南，最終陳近南鬆口，同意了一直反對的肖鵬反刺殺提議。
次日，延平郡王鄭經與其子鄭克塽的屍體便被人發現，鄭王府大軍投降，天下再無可與天地會抗衡的勢力。
歷經六年徵戰，天地會終於入主紫禁城，陳近南登基為帝，恢複大明國號，改元新紀，表明此乃大明的新紀元。
陳近南登基之後，大封功臣，肖鵬、洪熙官、方世玉、胡惠乾等人位列三公，當然，這只是爵位罷了，無定員，無專責，實為一個公爵的虛銜。
但眾人也並無不滿，因為他們畢竟只是武夫，不懂什麼治國之策。
三德回到南少林，重建了少林寺，三德任方丈，少林的重建自然得到了陳近南的大力支援。
之後陳近南廣開科舉，選拔賢才，一時間，天下寒門士子的春天到了，不過肖鵬雖只有爵位，無甚官職，但他依然給陳近南提出了許多有利國家發展的好建議。
陳近南這才開始重新審視肖鵬，沒想到自己這個義弟不僅武功通神，對於治國也有如此大才。
基於此事他想到更多，以肖鵬的武功才能與智計，若要悄無聲息的弄死自己，自己做皇帝也是輕而易舉。
可他一直只是任勞任怨，安心做自己手下一員大將，其忠義日月可鑒，故而陳近南越發的信任肖鵬，無論遇到什麼事都會與他商議一番。
而每次商議肖鵬都不會讓他失望，總能給出完美的建議，讓他的執政之路輕松無比。