太元六年夏末秋初之際，荊州桓玄對建康發動突襲，晉孝武帝司馬曜得禁軍統領衛階護衛，提前撤至石頭城暫避，同年冬末，謝玄統北府兵大破荊州軍於建康城外，收復建康，並迎回司馬曜。
桓玄兵亂，僅僅持續四個多月便宣告結束，建康城再次回到司馬王朝的統治之下，建康城內的百姓也許並沒感覺到前後的差異，然而朝堂之上的文武百官卻個個都心知肚明，這大晉朝的天，至此只怕是真的變了！
原本已經退出朝堂的謝安，在文武百官聯名上奏下，官復原職，重新擔任朝廷的中書令，而北府兵大統領謝玄，則獲封驃騎大將軍，軍政要職再次回到謝家人的手上！
雖然是百官聯名上奏，司馬曜並不想就此屈服，尤其是驃騎大將軍這個職位，平復桓玄兵亂，衛階也出力不少，原本他的打算是想擢升衛階為驃騎大將軍，來做這個兵馬大元帥。
只是衛階心中清楚，就算讓他做上這個位置，也不過是虛有其表罷了，被人擺上桌面，更容易遭到針對，故而力勸司馬曜放棄了這個想法，讓他暫時還是以隱忍為上。
不過衛階也並非毫無動作，此前在劉穆之的提醒下，他已經有了在北府兵之中扶植劉裕，與謝玄分庭抗禮的打算，朝廷論功行賞的詔書上也就多了一條，北府兵偏將劉裕，平亂有功，刺封其為虎威大將軍，任北府兵參軍一職，領青州刺史之位。
這是讓劉裕徹底取代了此前的劉牢之，無論是在北府兵之中的地位，還是青州府這塊封地！
同時司馬休之先是釋出討賊械文，而後又領兵參與討伐桓玄，也獲得司馬曜的封賞，雖然官階已然是淮南太守，但是軍銜卻是跳幾級，也被封了一個宣武將軍！
司馬休之繼續領軍鎮守淮南，只是從此以後，樂屬軍行事，再也不用向司馬道子彙報，而是直接向司馬曜這個皇帝負責。
衛階和司馬曜聯手力捧劉裕和司馬休之，二人確是都是有功在身，加上司馬曜畢竟還是名義上的皇帝，這個詔書的頒佈，並沒有引起什麼異議，只是另一方面，謝安也沒有放棄進一步鞏固自己的勢力。
而其中最讓人覺得牽強，卻不出衛階意料的是，曾經任職樂屬軍統領，副統領的衛噪，被謝安以平穩建康民生有功為由，上書司馬曜，為其請求封賞，實際上上書也不過是走一下形勢，衛噪最終還是被朝廷任命為尚書令，官居三品，品級甚至高過了殷仲堪和劉裕。
而最讓衛階沒想到的是，昔日好友，久未見面的袁湛竟然也在謝安的請功表之中，孫恩之亂後，袁湛一直都在會稽主理事務，期間司馬元顯雖然有回過會稽，不過不知何故，袁湛也一直留在了會稽，並沒有因此而回建康。
袁湛被擢升為御史中郎將，官居四品，謝安上書的理由是，桓玄動亂期間，袁湛鎮邊有功！
不知是否因為袁湛還未回到建康，謝安為他請賞之時，他並未隨同謝安一起上朝，而衛階自然沒有機會見到袁湛，心中的疑惑也就無人排解。
林林總總幾日之後，建康城內終於恢復了以往的平靜！
一切歸於平靜之後，有件事，有個人，衛階終於是推無可推，不得不去面對了，這個人就是衛噪。
從石頭城回來後，王氏就一直要求衛階與她一起去到衛家大院，向衛噪這個大哥請罪，都被衛階以各種理由推脫，只是一推再推之下，他終於是再也找不到足以應付王氏的藉口了。
衛階像是一個被押解的犯人一般被王氏押到了衛家大院，見到衛噪後，讓衛階頗感欣慰的是，衛噪雖然對他不冷不熱，不時選擇無視，但是對於母親王氏，還是極為的恭順。
“階兒，怎麼不開口說話？難道忘記怎麼答應孃親的了嗎？”王氏看了一眼左顧右盼，卻又一直不開口說話的衛階，略顯不悅地說道。
“呃，大哥，對不住，此前因為時間緊急，故而沒有通知大哥與我等一起去石頭城，還望大哥莫要見怪！”衛階勉強堆起帶著歉意的笑容，對著衛噪說道。